FQ Bioinformatique structurale 3 : prédiction de complexes par docking

Etre à l’aise dans la construction de modèles structuraux de complexes connaissant celle des partenaires, à l’aide d’outils bioinformatiques.

Une fonction biologique donnée est assurée dans de nombreux cas par la formation de complexes protéiques. La détermination de la structure 3D de tels complexes est particulièrement délicate d’un point de vue expérimental. La prédiction d’assemblages s’avère donc utile pour comprendre les mécanismes fonctionnels.

Les notions de description de surface moléculaire, d’arrimage moléculaire (« docking ») et d’évaluation quantitative des complexes formés (« scoring ») seront introduites.

Différents systèmes représentatifs de problèmes biologiques importants seront abordés sous forme d’exemples pratiques. Ils mettront en avant les difficultés techniques dans de telles recherches.

L’utilisation des données (biologiques, biophysiques, biochimiques) et leur traduction sous forme de contraintes ou de filtres constituera un point significatif de la formation.