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TYPE DE DIPLOME : Formation qualifiante

FQ Bioinformatique structurale 4 : dynamique de protéines

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
 
Spécialité : Bioinformatique
  • Faculté

    Faculté des Sciences

Présentation

Objectifs

La dynamique d’une macromolécule biologique joue un rôle prépondérant pour l’accomplissement de sa fonction.
L’objectif de la formation est d’initier les participant.e.s à différentes méthodes in silico permettant de fournir des informations dynamiques et conformationnelles.

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Compétences visées

Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches. Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.

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Programme

Partie théorique (8h)

Les échelles de temps, les échelles de mouvement

Dynamique moléculaire

Modèles élastiques

Analyse de trajectoires et exploration de données structurales au cours du temps

Partie pratique (27h)

Dynamique d’une protéine globulaire

Dynamique d’une protéine transmembranaire

Changement conformationnel de grande amplitude par dynamique vibrationnelle.

Durée de la formation:

Du 21 au 25 juin 2021

5 jours / 35 heures

2450 €

(TVA 0% incluse)

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Contrôle des connaissances

MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXECUTION DE L’ACTION ET D’EN APPRECIER LES RESULTATS:
Liste d’émargement
Questionnaire de satisfaction

MODALITES D’EVALUATION:
Attestation de formation délivrée par l’Université

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Aménagements particuliers

MOYENS PEDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:

Ressources humaines :
Enseignant.e.s-chercheur.e.s de l’Université Paris Diderot

Ressources matérielles :
Supports pédagogiques format PDF sur clé USB

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Admission

Public cible

Technicien.ne.s, ingénieur.e.s et chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.


Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.

 

 

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Pré-requis

Connaissance de base en structures 3D des protéines. La connaissance de l’environnement Unix/Linux est recommandée.

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Droits de scolarité

2450 €

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Contacts

  • Reine RIGAULT

    Contact administratif
    • 01 57 27 82 34
    • reine.rigault@u-paris.fr
  • Catherine Etchebest

    Correspondant pédagogique
    • catherine.etchebest@u-paris.fr
  • Delphine Flatters

    Correspondant pédagogique
    • delphine.flatters@u-paris.fr

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