Durée
4 jours (28 heures)
Faculté
Faculté des Sciences
Présentation
Référence formation : FQ-S30FQMOD
Responsable(s) pédagogique : Pr C.Etchebest, Dr D.Flatters
Forme de l'enseignement : en présentiel
Objectifs
Acquisition des notions théoriques récentes sur l’analyse de la structure des protéines.
Compétences visées
A l’issue de la formation, l’apprenant est capable de :
- Utiliser des notions théoriques récentes sur l’analyse de la structure des protéines.
- Appliquer des méthodes directement sur les projets scientifiques des participants
Programme
Référence formation : FQ-S30FQMOD
Volume horaire : 28 heures
Calendrier : Du 31 au 3 avril 2025
Rythme : 4 jours
Lieu : Campus des Grands Moulins
CONTENUS PÉDAGOGIQUES:
- Partie théorique (2h par jour)
De la séquence à la structure
Élaboration de modèles structuraux sur la base de structures connues de protéines homologues.
Principes de la modélisation par homologie
Rappels sur les familles de repliement protéique
Description des bases de données de structures : Protein Data Bank
Alignements de séquences et structures
Sélection des cibles structurales, construction des squelettes polypeptidiques, boucles et structures secondaires
Les chaînes latérales : description des conformations. Outils de construction
Optimisation des structures construites sur la base de critères énergétiques : notion de champ de force
Évaluation des modèles construits. Recommandations
Cas particulier des protéines membranaires : prédiction des segments transmembranaires
- Partie pratique (5h par jour)
Sur des stations LINUX ou WINDOWS
Rappels d’utilisation des programmes d’analyse de séquence (le choix des différents programmes est essentiellement basé sur leur disponibilité et gratuité via Internet)
Initiation aux programmes de modélisation par homologie SwissPdbViewer, Modeller
Prédiction de la conformation des chaînes latérales
L’accent sera mis sur les limites des différentes approches et les précautions à respecter dans le cadre de ces différents outils
MOYENS PÉDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:
Responsable pédagogique : Dr D.Flatters
Ressources matérielles
Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :
- d'échanger des fichiers, des données
- de partager des ressources, des informations : Supports pédagogiques format PDF sur clé USB
- de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.
MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE LA FORMATION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS
Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.
À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne, à chaud. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.
Contrôle des connaissances
Attestation : à l'issue de la formation, il est remis un certificat de réalisation, attestant de l'acquisition des compétences.
Aménagements particuliers
Admission
Public cible
- Technicien.ne.s, ingénieur.e.s
- Chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
- Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.
Conditions d'admission
L'entrée en formation nécessite un avis pédagogique.
- votre Curriculum Vitae
- votre lettre de motivation pour participer à la formation
- vos diplômes vous permettant de justifier l'accès à la formation
Pré-requis
Connaissance de base recommandée de l’environnement Unix/Linux.
Les clefs de la réussite
Des fiches pratiques sont à votre disposition sur la page http://www.reussir-en-universite.fr/index.html.
Modalités de candidature
Contacter Reine RIGAULT pour les inscriptions:
reine.rigault@u-paris.fr
Droits de scolarité
FRAIS DE FORMATION* selon votre profil
- Pour toute personne bénéficiant d’une prise en charge totale ou partielle : 1 712 €
- Pour toute personne finançant seule sa formation : 787 €
*Les tarifs des frais de formation et des frais de dossier sont sous réserve de modification par les instances de l’Université.
Cliquez ici pour lire les Conditions Générales de vente / Outils de l’adulte en Formation Continue / Documents institutionnels / CGV hors VAE
Et après ?
Poursuites d'études
Vous pouvez toujours compléter ou acquérir de nouvelles compétences en vous inscrivant à d'autres diplômes d'université, des formations qualifiantes ou des séminaires.
Contacts
Dernière mise à jour le 11 octobre 2024
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