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TYPE DE DIPLOME : Formation qualifiante

FQ Bioinformatique structurale 4 : dynamique de protéines

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
 
Spécialité : Bioinformatique
  • Faculté

    Faculté des Sciences

Présentation

Référence formation (à rappeler dans toute correspondance) : FQ-S30DYPRO

Responsable(s) pédagogique : Pr C. Etchebest, Drs P. Fuchs et D. Flatters

Forme de l'enseignement : en présentiel

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Objectifs

La dynamique d’une macromolécule biologique joue un rôle prépondérant pour l’accomplissement de sa fonction. L’objectif est d’initier les participant.e.s à différentes méthodes in silico permettant de fournir des informations dynamiques et conformationnelles.

Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches. Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.

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Compétences visées

Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches.
Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.

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Programme

Référence formation : FQ-S30DYPRO

Volume horaire : 35 heures

Calendrier : Du 20 au 24 juin 2022

Rythme : Sur 5 jours

Lieu : Campus des Grands Moulins

CONTENUS PÉDAGOGIQUES:

  • Partie théorique (8h)
    • Les échelles de temps, les échelles de mouvement
    • Dynamique moléculaire
    • Modèles élastiques
    • Analyse de trajectoires et exploration de données structurales au cours du temps
  • Partie pratique (27h)
    • Dynamique d’une protéine globulaire
    • Dynamique d’une protéine transmembranaire
    • Changement conformationnel de grande amplitude par dynamique vibrationnelle.

MOYENS PÉDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:

Responsable pédagogique : Pr C. Etchebest

Coordinateur pédagogique : Dr P.Fuchs

Autres membres de l’équipe pédagogique : Dr D.Flatters

Ressources matérielles : Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :

  • d'échanger des fichiers, des données
  • de partager des ressources, des informations : supports pédagogiques format PDF sur clé USB
  • de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.

MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE LA FORMATION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS

Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.

À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne, à chaud. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.

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Contrôle des connaissances

 Attestation : à l'issue de la formation, il est remis un certificat de réalisation, attestant de l'acquisition des compétences.

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Aménagements particuliers

Université de Paris s’engage pour un accueil et un accompagnement personnalisé des personnes en situation de handicap, tout au long de leur parcours de formation.

Pour plus d’informations sur les modalités et pour avoir le contact de votre interlocuteur, veuillez cliquer ici.

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Admission

Public cible

  • Technicien.ne.s
  • Ingénieur.e.s et chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
  • Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.

 

 

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Conditions d'admission

Pré-requis

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Pré-requis

Connaissance de base en structures 3D des protéines. La connaissance de l’environnement Unix/Linux est recommandée.

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Les clefs de la réussite

Des fiches pratiques sont à votre disposition sur la page http://www.reussir-en-universite.fr/index.html.

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Modalités de candidature

Contacter Reine RIGAULT pour les inscriptions:

reine.rigault@u-paris.fr

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Droits de scolarité

Pour toute personne bénéficiant d’une prise en charge totale ou partielle : 2450 €

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Et après ?

Poursuite d'études

Vous pouvez toujours compléter ou acquérir de nouvelles compétences en vous inscrivant à d'autres formatons qualifiatnes, des diplômes d'université ou des séminaires.

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Contacts

  • Catherine Etchebest

    Correspondant pédagogique
    • catherine.etchebest @ u-paris.fr
  • Delphine Flatters

    Correspondant pédagogique
    • delphine.flatters @ u-paris.fr
  • Reine RIGAULT

    Contact administratif
    • 01 57 27 82 34
    • reine.rigault @ u-paris.fr

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