Durée
35 heures
Faculté
Faculté des Sciences
Présentation
Référence formation (à rappeler dans toute correspondance) : FQ-S30DYPRO
Responsable(s) pédagogique : Pr C. Etchebest, Drs P. Fuchs et D. Flatters
Forme de l'enseignement : en présentiel
Objectifs
La dynamique d’une macromolécule biologique joue un rôle prépondérant pour l’accomplissement de sa fonction. L’objectif est d’initier les participant.e.s à différentes méthodes in silico permettant de fournir des informations dynamiques et conformationnelles.
Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches. Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.
Compétences visées
Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches.
Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.
Programme
Référence formation : FQ-S30DYPRO
Volume horaire : 35 heures
Calendrier : 25-29 mars 2024
Rythme : Sur 5 jours
Lieu : Campus des Grands Moulins
CONTENUS PÉDAGOGIQUES:
- Partie théorique (8h)
- Les échelles de temps, les échelles de mouvement
- Dynamique moléculaire
- Modèles élastiques
- Analyse de trajectoires et exploration de données structurales au cours du temps
- Partie pratique (27h)
- Dynamique d’une protéine globulaire
- Dynamique d’une protéine transmembranaire
- Changement conformationnel de grande amplitude par dynamique vibrationnelle.
MOYENS PÉDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:
Responsable pédagogique : Pr C. Etchebest
Coordinateur pédagogique : Dr P.Fuchs
Autres membres de l’équipe pédagogique : Dr D.Flatters
Ressources matérielles : Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :
- d'échanger des fichiers, des données
- de partager des ressources, des informations : supports pédagogiques format PDF sur clé USB
- de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.
MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE LA FORMATION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS
Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.
À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne, à chaud. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.
Contrôle des connaissances
Attestation : à l'issue de la formation, il est remis un certificat de réalisation, attestant de l'acquisition des compétences.
Aménagements particuliers
Admission
Public cible
- Technicien.ne.s
- Ingénieur.e.s et chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
- Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.
Conditions d'admission
L'entrée en formation nécessite un avis pédagogique, après examen de :
- votre Curriculum Vitae
- votre lettre de motivation pour participer à la formation
- vos diplômes vous permettant de justifier l'accès à la formation
Pré-requis
Connaissance de base en structures 3D des protéines. La connaissance de l’environnement Unix/Linux est recommandée.
Les clefs de la réussite
Des fiches pratiques sont à votre disposition sur la page http://www.reussir-en-universite.fr/index.html.
Modalités de candidature
Contacter Reine RIGAULT pour les inscriptions:
reine.rigault@u-paris.fr
Droits de scolarité
FRAIS DE FORMATION* selon votre profil
- Pour toute personne bénéficiant d’une prise en charge totale ou partielle : 2 622 €
- Pour toute personne finançant seule sa formation : 1 236 €
*Les tarifs des frais de formation et des frais de dossier sont sous réserve de modification par les instances de l’Université.
Et après ?
Poursuites d'études
Vous pouvez toujours compléter ou acquérir de nouvelles compétences en vous inscrivant à d'autres formatons qualifiatnes, des diplômes d'université ou des séminaires.
Contacts
Dernière mise à jour le 6 novembre 2023
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