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TYPE DE DIPLOME : Formation qualifiante

FQ Initiation à la programmation informatique pour les biologistes : UNIX

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
 
Spécialité : Informatique
  • Durée

    28 heures (4 jours)

  • Faculté

    Faculté des Sciences

Présentation

Objectifs

Prendre en main le système d’exploitation Unix / Linux (Linux signifie Unix libre). Apprendre à gérer des fichiers, extraire de l’information ou modifier les formats de fichiers via un shell Unix. Savoir utiliser des programmes appliqués à la Biologie sous Unix.

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Programme

Partie théorique (3h30 par jour)

Caractéristiques générales du système UNIX

Utilisation du Shell

Le Shell : interpréteur de commande

Manipulation des données d’un fichier (expressions régulières, outils grep, sed, awk)

Le Shell : langage de programmation

 

Partie pratique (3h30 par jour)

Sur des stations LINUX, UNIX ou Macintosh :

Gestion de votre compte et password

Gestion des fichiers, filtrer les fichiers

Gérer les répertoires

Introduction à la programmation sous UNIX

MOYENS PEDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:

Ressources humaines :
Enseignant.e.s-chercheur.e.s de l’Université Paris Diderot

Ressources matérielles :
Les cours pratiques seront réalisés en salles informatique sur des
machines Linux de l’UFR Sciences du Vivant.
Supports pédagogiques format PDF sur clé USB

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Contrôle des connaissances

Attestation : à l'issue de la formation, il est remis un certificat de réalisation, attestant de l'acquisition des compétences. 

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Admission

Public cible

Technicien.ne.s, ingénieur.e.s, chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
C’est le système prioritairement utilisé par la communauté scientifique pour développer des programmes pour les biologistes. Il est déjà installé sur tous les ordinateurs Macintosh. Sous Windows 10, il est également possible d’installer le système Linux Ubuntu très facilement.

Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.

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Pré-requis

Savoir utiliser un ordinateur pour les fonctions simples de bureautique et l’accès à internet.

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Les clefs de la réussite

Des fiches pratiques sont à votre disposition sur la page http://www.reussir-en-universite.fr/index.html.

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Contacts

  • Reine Rigault

    Contact administratif
    • 01 57 27 82 34
    • reine.rigault @ u-paris.fr

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