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TYPE DE DIPLOME : Formation qualifiante

FQ Programmation pour les biologistes : Python 2

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
 
Spécialité : Programmation ; Biologie
  • Faculté

    Faculté des Sciences

Présentation

Compétences visées

Etre à l’aise avec la programmation objet dans un contexte d’analyse bioinformatique.

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Programme

Partie théorique (3h par jour)

Programmation objet en PYTHON : classes et héritage

Scripting, wrap de programmes externes

Interface PYTHON/C/R ou le module BIOPYTHON

 

Partie pratique (3h par jour)

Applications directes de la partie théorique avec comme finalité :

Conception d’une classe minimale pour l’analyse de fichiers de séquence au format FASTA

Interface avec un programme externe comme CLUSTALW

Extension d’une classe pour parser les structures au format PDB

 

du 15 au 17 mai 2018

3 jours / 18 heures

1350 €

(TVA 0% incluse)

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Admission

Public cible

Techniciens, ingénieurs et chercheurs des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.

 

 

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Pré-requis

Avoir suivi la formation Python 1 ou en avoir les compétences.

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Droits de scolarité

1350 €

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Contacts

  • Francoise Peuvion-Chalaux

    Contact administratif
    • 0157278234
    • fcsdv@univ-paris-diderot.fr

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