Durée
35 heures
Faculté
Faculté des Sciences
Présentation
IMPORTANT : PAS D'OUVERTURE DES INSCRIPTIONS EN 2022-2023. NOUS RECONTACTER POUR 2023-2024
Référence formation (à rappeler dans toute correspondance) : FQ-S30FQPRO
Responsable(s) de l'enseignement : Dr Wassim EL NEMER et Pr Caroline LE VAN KIM
Forme de l'enseignement : en présentiel
Objectifs
La formation, composée d’une partie théorique et d’une partie pratique, vise à explorer les interactions protéine-protéine et à initier les participant.e.s aux approches expérimentales utilisées pour rechercher de nouveaux partenaires d’une protéine candidate ou pour valider les interactions de partenaires protéiques potentiels. L’objectif de la partie théorique est de présenter la nature biochimique des interactions protéiques et d’aborder les différentes méthodes utilisées pour les analyser, telles que le double hybride dans la levure, la microscopie optique de fluorescence (co-immunolocalisation, FRET, Duolink®…), les méthodes biochimiques (co-immunoprécipitation et pontage moléculaire, capture par « GST-pulldown »…) et la résonance plasmonique de surface. Dans la partie pratique, trois approches expérimentales sont utilisées pour explorer les interactions au sein d’un complexe protéique, avec des expériences en système cellulaire et in vitro : Co-immunoprécipitation : biotinylation, pontage moléculaire par « cross-linker » et immunoprécipitation de protéines de surface cellulaire | « Proximity Ligation Assay » Duolink® | Résonance plasmonique de surface : système BIAcore
Compétences visées
Etre familiarisé-e aux techniques d’analyse des interactions « protéine-protéine » en explorant ces interactions par différentes approches expérimentales. Apprendre à effectuer (1) une co-immunoprecipitation avec marquage et pontage moléculaire, suivie de Western blot, (2) un immuno-marquage et un PLA (Duolink®) sur cellules vivantes ou fixées, (3) concevoir une analyse par résonance plasmonique de surface.
Programme
PARTIE THÉORIQUE (10H)
LES DIFFÉRENTS TYPES D’INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE
ANALYSE D’UNE INTERACTION PROTÉINE-PROTÉINE
► Les méthodes utilisées : le double hybride dans la levure, la co-immunolocalisation, le FRET, la co-immunoprécipitation et le pontage moléculaire, la capture par « GST-pulldown », la technologie Duolink®
► L’analyse quantitative en temps réel : la résonance plasmonique de surface
RECHERCHE DE PARTENAIRES PROTÉIQUES
► Par crible en double hybride dans la levure
► Approche protéomique
PARTIE PRATIQUE (25H)
INTERACTION PROTÉINE-PROTÉINE EN SYSTÈME CELLULAIRE
► Par co-immunoprécipitation : biotinylation, pontage moléculaire par « cross-linker » et immunoprécipitation de protéines de surface cellulaire
► Par la technologie Duolink® basée sur le principe du « Proximity Ligation Assay »
INTERACTION PROTÉINE-PROTÉINE EN SYSTÈME IN VITRO
► La résonance plasmonique de surface : système BIAcore
► Interaction antigène-anticorps
► Analyse en temps réel de l’interaction entre deux protéines
Des modifications mineures peuvent être apportées sous la
responsabilité de l’encadrement pédagogique
Ressources humaines :
Encadrement par des enseignant.e.s-chercheur.e.s de l’Université et des intervenant.e.s extérieur.e.s
Ressources matérielles :
Supports pédagogiques remis en version papier et sous format PDF sur clés USB.
Du 16 novembre au 20 novembre 2020
4,5 jours / 35 heures
2250 €
(TVA 0% incluse)
Ressources matérielles
Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :
- d'échanger des fichiers, des données
- de partager des ressources, des informations
- de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.
MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE LA FORMATION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS
Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne, à chaud. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.
Contrôle des connaissances
Attestation : à l'issue de la formation, il est remis un certificat de réalisation, attestant de l'acquisition des compétences.
Aménagements particuliers
Admission
Public cible
Technicien.ne.s, ingénieur.e.s et chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 12 maximum
Conditions d'admission
L'entrée en formation nécessite un avis pédagogique, après examen de :
- votre Curriculum Vitae
- votre lettre de motivation pour participer à la formation
- vos diplômes vous permettant de justifier l'accès à la formation
Pré-requis
Connaissances de base en biologie générale et en biochimie des protéines ; pratique expérimentale.
Les clefs de la réussite
Des fiches pratiques sont à votre disposition sur la page http://www.reussir-en-universite.fr/index.html.
Modalités de candidature
Contacter Reine RIGAULT pour les inscriptions:
reine.rigault@u-paris.fr
Droits de scolarité
FRAIS DE FORMATION* selon votre profil
- Pour toute personne bénéficiant d’une prise en charge totale ou partielle : 2 250 €
- Pour toute personne finançant seule sa formation : 1 071€
*Les tarifs des frais de formation et des frais de dossier sont sous réserve de modification par les instances de l’Université.
Contacts
Dernière mise à jour le 21 février 2024
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