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Master Biologie Moléculaire et Cellulaire - Parcours : Microbiologie

Domaine : Sciences, Technologies, Santé
 
 
  • ECTS

    120 crédits

  • Niveau d'études visé

    BAC +5

  • Durée

    2 ans

  • Faculté

    Faculté des Sciences

  • Langue des enseignements

    Français, Anglais

Présentation

Le master Biologie Moléculaire et Cellulaire est une formation théorique et pratique de haut niveau en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire offrant une vision intégrée des propriétés moléculaires, cellulaires et fonctionnelles des systèmes biologiques nécessaire à la compréhension des processus physiologiques et pathologiques.

Formation par et à la recherche et progressive dès le Master 1, le master Biologie Moléculaire et Cellulaire permet l'orientation vers 9 parcours de Master 2 (Hématopoïèse, biologie et pathologie moléculaires, développement cellulaire, inflammation, immunologie, microbiologie, virologie et biothérapies)

Le parcours Microbiologie du Master BMC est une formation d’excellence par la recherche. La priorité est donnée à des approches intégrées, visant à comprendre la physiologie des microorganismes qui vont des aspects moléculaires fondamentaux à la biologie globale et évolutive et à étudier leur fonctionnement dans leur environnement naturel et leur impact sur les écosystèmes. Ce parcours forme à la conduite d’un projet de recherche expérimental et à l’analyse critique de données. Ces compétences sont exercées en environnement professionnel lors de la réalisation du stage de 6 mois en laboratoire de recherche. Les laboratoires d’accueil sélectionnés sont des structures reconnues pour leur production scientifique et leur capacité d’encadrement et de formation.

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Objectifs

Objectifs communs du master

  • Acquérir, interpréter et appliquer les connaissances en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire pour comprendre les processus physiologiques et pathologiques en hématopoïèse, développement cellulaire, inflammation, immunologie, microbiologie, virologie et biothérapies.
  • Connaitre, appliquer et développer des approches expérimentales dans les champs du master.
  • Contribuer au développement et à la réalisation d'un projet de recherche en équipe
  • Communiquer et diffuser à l'oral et à l'écrit

Objectifs spécifiques du parcours

  • Acquérir et mettre en œuvre les technologies de pointe en microbiologie moderne: génomique fonctionnelle, comparative et structurale, biologie des systèmes et de synthèse
  • Contribuer à la réalisation d’un programme de recherche avec rapport écrit et présentation orale assortis d’une analyse critique
  • Etudier la biodiversité, l’évolution, la régulation, les relations hôtes-pathogèneset les mécanismes adaptatifs chez les microorganismes
  • Etudier la résistance aux antibiotiqueset les moyens de contrôle antimicrobien
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Compétences visées

  • Participer à la conception, la réalisation, la diffusion et la valorisation d’un projet de recherche en microbiologie
  • Maîtriser et utiliser les protocoles expérimentaux du domaine

Compétences pré-professionnelles :

  • Élaborer des systèmes d’hypothèses et des schémas expérimentaux associés
  • Produire, rechercher et traiter des documents de communication orale ou écrite des travaux, savoir les interpréter et les enseigner
  • Connaissance et respect de la règlementation (biosécurité, biosûreté, éthique)
  • Préparer les étudiants à une autonomie conceptuelle et expérimentale relative nécessaire à la préparation d'une thèse ou à l’intégration en laboratoire de recherche ou en entreprise.
  • Capacité à manager des projets
  • Former à la recherche des étudiants du secteur santé (médecins/pharmaciens)
  • Préparer aux métiers de la recherche et du développement en microbiologie et biotechnologies microbiennes

 

Compétences personnelles :

  • Maîtriser les techniques d'expression écrite et orale
  • Sens de l’organisation et de la rigueur
  • Savoir convaincre et défendre un projet
  • Savoir synthétiser des données et connaissances
  • Capacité à collecter des données multiples, réaliser leur analyse et maîtriser les outils de bioinformatique
  • Travailler en équipe, en réseau et en autonomie
  • Travailler en anglais
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Ils en parlent

Doctorant à l’Institut Pasteur (M2 en 2019-2020)

Après un DUT Génie Biologique et un L3, je suis rentré à Paris-Diderot pour faire le master BMC avec une spécialisation en Microbiologie. Le M1, très complet, aborde un nombre varié de disciplines tout en permettant une prespécialisation en S2. Pour mon M2, j’ai choisi le parcours de Microbiologie Fondamentale à l’Institut Pasteur, pleinement épanouissant grâce à l’enseignement théorique et pratique de haut niveau que nous avons pu avoir. Le stage en laboratoire de recherche de 6 mois à l’Institut Pasteur m’a permis de préparer au mieux le projet de thèse que je réalise actuellement.

Etudiant en thèse à Londres (M2 en 2017-18)

Au cours de ma licence aux Antilles, j'ai réalisé un stage en microbiologie marine qui m'a donné l'envie de me spécialiser dans ce domaine, et particulièrement en infectiologie à l'université Paris Diderot par ce Master qui allie un socle commun solide permettant d'élargir sa palette de connaissances, tout en ayant la possibilité de personnaliser son parcours en M1 et  M2 via le parcours de Microbiologie Fondamentale qui offrait la possibilité de suivre des enseignements théoriques et pratiques à l'Institut Pasteur. Cela offre l’opportunité de rencontrer des futurs employeurs pour une thèse notamment. J'ai pu réaliser mon stage de M2 au sein d'un laboratoire à l'institut Pasteur de Paris puis une thèse à Londres.

Etudiante attachée scientifique en industrie pharmaceutique en CDI (M2 en 2016-17)

Après l’obtention d’une licence en Sciences pour la Santé à l’Université Paris Descartes, j'ai suivi le Master BMC/IMVI en me spécialisant en Microbiologie, pour ensuite faire le parcours de M2 Mycologie environnementale et médicale. J'ai beaucoup appris lors de mon parcours, grâce à cette formation très complète. Même si la formation est axée principalement vers la recherche, elle m'a permis d’acquérir des compétences diversifiées et une réelle expérience qui sont des atouts importants aussi recherchés en entreprise tels que la capacité à réfléchir à des problèmes complexes et la capacité d'adaptation... J'ai décidé de ne pas poursuivre une thèse et j'ai été embauchée en CDI en tant qu'attachée scientifique en information médicale en industrie pharmaceutique 

 

 

Programme

Master 1 : 60 ECTS sur 2 semestres.

Semestre 1 (enseignements socles + TP) 

Semestre 2 : pré-spécialisation via 5 axes au choix (18 ECTS) + 12 ECTS d’UE optionnelles:

  • Biomolécules, biologie moléculaire
  • Biologie cellulaire
  • Immunologie
  • Virologie
  • Microbiologie

 

Master 2 : 60 ECTS dont 30 de stage de recherche en laboratoire ou entreprise (2nd semestre)

Ce parcours « Microbiologie » du M2 BMC  propose trois filières :

  • Microbiologie Fondamentale (MF)
  • Bactériologie Moléculaire et Médicale (BMM)
  • Mycologie Environnementale et Médicale (MEM)

MF s’adresse aux étudiants intéressés par les mécanismes moléculaires génériques du fonctionnement des microorganismes. BMM est orienté vers l’étude des bactéries à impact médical et MEM vers l’étude des champignons microscopiques.

Semestre 3:

Enseignements communs

  • Tronc commun de cours en anglais (3 ECTS)
  • Séminaires d’analyse d’articles/Rédaction de revue en anglais (6 ECTS)

Enseignements spécifiques à chaque parcours

Filière  MF

  • Conférences d’actualité en bactériologie (3 ECTS)
  • TP encadrés par des équipes de l’Institut Pasteur sur une bactérie pathogène (12 ECTS).
  • Biodiversité microbienne (6 ECTS)

Filière  BMM

  • Conférences d’actualité en bactériologie (3 ECTS)
  • Modules : Interaction hôte-pathogènes, Génétique Microbienne, Epidémiologie, Résistance aux antibiotiques (12 ECTS)
  • TP sur la résistance aux antibiotiques (6 ECTS)

Filière  MEM

  • Outils modernes en mycologie (6 ECTS)
  • Cours de laboratoire au LIED sur la génétique de Podospora (12 ECTS)
  • UE libre (3 ECTS)

Semestre 4:

Stage de 6 mois en laboratoire de recherche, mémoire et soutenance orale

Contrôle des connaissances

MCC contrôle continu et/ou examen terminal avec des présentations orales et/ou écrites pour les séminaires et les stages

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Sélectionnez un programme

Master 1 Biologie Moléculaire et Cellulaire

  • Architectures macromoléculaires et réactions biologiques

    6 crédits
  • Structure, transmission et expression des génomes

    6 crédits
  • Biologie cellulaire

    6 crédits
  • Bioinformatique

    3 crédits
  • Anglais

    3 crédits
  • Ateliers experimentaux

    3 crédits
  • UE Indiférenciée

    3 crédits
    • Au choix : 1 parmi 6

      • Immunologie générale

        3 crédits
      • Biologie intégrative et biologie de synthèse

        3 crédits
      • Facteurs de virulence et réponse immunitaire de l’hôte

        3 crédits
      • Biologie computationnelle

        3 crédits
      • Immersion dans une unité de recherche : de la théorie à la paillasse

        3 crédits
      • Pharmacogénomique des enzymes du métabolisme des xénobiotiques

        3 crédits
  • Au choix : 1 parmi 2

    • Axe Biomolécules et cellules

      18 crédits
      • Au choix : 1 parmi 2

        • Biomolécules, Biologie moléculaire

          18 crédits
          • Structure et dynamique des macromolécules biologiques

            6 crédits
          • Pathologie moléculaire

            6 crédits
          • Biotechnologie des interactions protéiques

            3 crédits
          • Enzymes : processus pathologiques et thérapies

            3 crédits
        • Biologie cellulaire

          18 crédits
          • Polarité, morphogenèse et mécanobiologie

            6 crédits
          • Stage de recherche

            6 crédits
          • Dynamique intracellulaire, organites, autophagie et glycobiologie

            3 crédits
          • Divisions cellulaires

            3 crédits
    • Axe Infectiologie : microbiologie, virologie, immunolgie

      18 crédits
      • Au choix : 1 parmi 3

        • Immunologie

          18 crédits
          • Immunologie fondamentale

            6 crédits
          • Dynamique des microorganismes et de leur hôte

            6 crédits
          • Immuno-physio pathologie

            6 crédits
        • Virologie

          18 crédits
          • Virologie

            6 crédits
          • Dynamique des microorganismes et de leur hôte

            6 crédits
          • Aspects prtaiques en virologie

            6 crédits
        • Microbiologie

          18 crédits
          • Origine, diversité et biologie des microorganismes eucaryotes

            6 crédits
          • Physiologie et génomique bactériennes

            6 crédits
          • Atelier génomique fonctionnelle et réseau de régulation chez les bactéries

            6 crédits
  • UEs Indiférenciées

    12 crédits
    • Au choix : 2 à 4 parmi 18

      • De l'immunologie à l'immunothérapie

        6 crédits
      • Diagnostique microbiologique

        3 crédits
      • Inflammation

        3 crédits
      • Introduction à l'hématologie

        3 crédits
      • Stage en laboratoire 1 mois

        3 crédits
      • Stage en laboratoire 2 mois

        6 crédits
      • De la structure moléculaire à l’IRM : la RMN un outil d’investigation en constante évolution

        3 crédits
      • Réactivité et Synthèse Organiques

        3 crédits
      • Projet tutoré

        3 crédits
      • Imagerie et analyse d'image

        3 crédits
      • Molécules et Matériaux thérapeutiques

        6 crédits
      • Gestion et Analyse financière de l'Entreprise

        3 crédits
      • Applications expérimentales des concepts émergents

        3 crédits
      • Immunologie fondamentale

        6 crédits
      • Stabilité des génomes et des épigénomes

        3 crédits
      • Migration cellulaire et dissémination tumorale

        3 crédits
      • Biologie Moléculaire et Développement

        3 crédits
      • Immunophysiopathologie

        6 crédits

Master 2 Biologie Moléculaire et Cellulaire - Parcours : Microbiologie

  • Conférences d'actualité en microbiologie

    6 crédits
  • Synthèse bibliographique

    6 crédits
  • Spécialisation

    • Au choix : 1 parmi 3

      • Spécialisation Microbiologie Fondamentale

        18 crédits
        • Microbiologie Fondamentale

          12 crédits
        • Atelier de Biodiversité Microbienne

          6 crédits
      • Spécialisation Bactériologique

        18 crédits
        • Conférences de Bactériologie Moléculaire et Médicale

          12 crédits
        • Approches expérimentales en Bactériologie Moléculaire et Médicale

          6 crédits
      • Spécialisation Mycologie

        18 crédits
        • Cours de Laboratoire de mycologie

          12 crédits
        • Outils modernes en mycologie

          6 crédits
  • Stage de recherche en laboratoire ou en entreprise

    30 crédits

Contrôle des connaissances

Contrôles continus et examens terminaux (oraux/écrits)

Stages et TP sur comptes rendus oraux/écrits

M2 : • Examens, Compte rendu de TP et/ou présentations orales (Septembre à Novembre selon les UEs)

  • mémoire et soutenance orale pour le stage (mi-Juin)
  • Pour connaitre le détail des modalités de contrôle des connaissances et compétences, nous vous invitons à prendre contact avec l’UFR (voir le lien en savoir+) 

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Tutorat

Un suivi est réalisé pour la conception puis la réalisation du stage sous forme d’un projet déposé sur le site du master 2 et d’entretiens avec les étudiants.

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Aménagements particuliers

Aménagements particuliers pour étudiants en situation de handicap ou sportifs de haut niveau

Étudiants en situation de handicap :

  • Relais handicap Campus des Grands Moulins
    Pour les étudiants du campus des Grands Moulins, Bichat, Villemin, Pajol, Cuvier, Garancière
    Bât. Halle aux Farines Hall E, RDC gauche – allée paire
    Rue Françoise Dolto Paris 13e
  • Relais handicap Campus des Grands Moulins
    01 57 27 65 20
    relais-grandsmoulins@u-paris.fr
  • Relais handicap Odéon
    Pour les étudiants des autres sites
    Bureau A.1.8 et A.1.9
    12 rue de l’Ecole de Médecine Paris 6e
    01 76 53 17 64
    01 76 53 17 01
    relais-odeon@u-paris.fr

(Privilégier les mails)

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Admission

Public cible

M1 : Titulaires de : Licence Sciences de la vie ou équivalent

M2 : Pour les étudiants hors filière santé, Master 1 BMC ou équivalent. Pour les étudiants de la filière santé (médecin/pharmacien) : deuxième cycle des études médicales validé et parcours recherche en Microbiologie ou Ecole de l’Inserm ou équivalent.

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Conditions d'admission

M1 : Bon niveau en Biologie moléculaire, cellulaire et structurale

M2 : Pour les étudiants hors filière santé, 9 ECTS dans la filière microbiologie ou équivalent. Pour les étudiants secteur santé, des UEs recherche en Microbiologie ou équivalent

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Pré-requis

M1 : Bon à très bon niveau en biologie moléculaire et structurale

Les stages en laboratoire sont un bonus.

Niveau de Français confirmé. Bonne maitrise de l'anglais scientifique exigé.

M2 : Bon à très bon niveau en Microbiologie

Projet professionnel clairement identifié et en adéquation avec la formation. Doctorat ou ingénieur recherche ou développement

Niveau de français B1 ou équivalent. Un bon niveau en anglais lu et écrit est exigé.

Des stages en laboratoire ou une expérience professionnelle sont un bonus.

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Modalités de candidature

M1 : Licence Sciences de la vie parcours Biochimie, Biologie Intégrative et Physiologie ou équivalent.

Bon à très bon niveau en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire.

M2 : Pour les étudiants hors filière santé, Master 1 BMC ou équivalent et avoir acquis 9 ECTS ou équivalent en Microbiologie en M1. Pour les étudiants de la filière santé (médecin/pharmacien) : deuxième cycle des études médicales validé et parcours recherche en Microbiologie ou Ecole de l’Inserm ou équivalent et avoir validé des UEs recherche en Microbiologie ou équivalent. Bon à très bon niveau en Microbiologie.

Date de début de candidature :

M1 5 avril 2021

M2 26 avril 2021

Date de fin de candidature :

M1 2 juillet 2021

M2 14 juin 2021

Les étudiants souhaitant intégrer un master à Université Paris Cité doivent candidater sur la plateforme de candidature eCandidat.
Ils y trouveront les dates et les modalités de candidatures et pourront déposer leur dossier directement en ligne.

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Droits de scolarité

Toute inscription à un diplôme national implique le paiement des droits de scolarités fixés annuellement par le ministère, et des frais de formation continue selon le profil. Retrouver tous les tarifs spécifiques au public en formation continue en cliquant ici 

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Et après ?

  • 100%

    Taux de réussite (Taux de réussite sur l’année de diplomation 2020-2021 (nombre d’admis par rapport au nombre d’inscrits administratifs))

Poursuite d'études

Formation visée

Poursuite d’étude en Doctorat (BioSPC, MTCI, CDV, ABIES, HOB, SDSV, SDV…)

Formation en École de management ou d’ingénieur

Finalisation des Études de médecine/pharmacie

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Passerelle

Des passerelles vers les études de santé sont ouvertes sur dossier pour les étudiants ayant validé leur master

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Débouchés professionnels

Métiers

  • Ingénieur.e d’études ou de production dans les disciplines de la microbiologie au sens large.
  • Chargé.e de projet, attaché.e de recherche clinique
  • Ingénieur.e brevets
  • Médiateur.trice scientifique
  • Enseignants
  • Après un doctorat, chercheur.euse, enseignants-chercheur.euse, ingénieur.e de recherche
  • carrière hospitalo-universitaire pour les étudiants des secteurs santé (médecins/pharmaciens)

Domaine et/ou Secteur d’activité

  • Fonction publique [Université, CNRS, INSERM, INRAE, CEA…..]
  • Laboratoires publics ou privés de recherche et développement
  • Communication ou valorisation scientifique
  • Enseignement
  • Hôpital
  • Distribution (traçabilité des produits)
  • Secteurs Pharmaceutique
  • Agroalimentaire
  • Biotechnologies
  • Environnement et énergie

 

Taux d’insertion

Plus de 95 % à deux ans ont un contrat doctoral, un CDD ou un CDI. Les étudiants en médecine reprennent leur parcours et font souvent un doctorat après l’internat.

 

Salaire d’embauche annuel à la sortie

1700-2000€ brut mensuel

  • CDI : moins de 10%
  • CDD : 40-50%
  • Contrat doctoral : 40-50%

 

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Référentiel

Référentiel RNCP

34272

Contacts

  • Mireille Viguier

    Co-responsable de la mention
    • mireille.viguier @ u-paris.fr
  • Fernando Rodrigues-Lima

    Co-responsable de la mention
    • fernando.rodrigues-lima @ u-paris.fr
  • Sabrina Pichon

    Co-responsable 1ère année
    • sabrina.pichon @ u-paris.fr
  • Sandie Munier

    Co-responsable 1ère année
    • sandie.munier @ pasteur.fr
  • Isabelle Martin-Verstraete

    Co-responsable 2ème année
    • iverstra @ pasteur.fr
  • Xavier Nassif

    Co-responsable 2ème année
    • xavier.nassif @ inserm.fr
  • Pascale Perez

    Secrétariat pédagogique 1ère année
    • 01 57 27 82 44
    • pascale.perez @ u-paris.fr
  • Adeline Le Gal

    Secrétariat pédagogique 2ème année
    • 01 57 27 82 47
    • adeline.le-gal @ u-paris.fr
  • Reine RIGAULT

    Formation Continue
    • 01 57 27 82 34
    • reine.rigault @ u-paris.fr

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