Master Génétique

Année de Master 1

Le semestre 1 est constitué d’UE obligatoires donnant aux étudiants un socle commun de connaissances en génétique, épigénétique, génomique, régulation de l’expression génique, développement, biologie cellulaire, analyse des données massives (-omiques) par l'utilisation d'outils bioinformatiques. Ces UE permettent aussi de développer des capacités essentielles à une future carrière professionnelle, formant les étudiants à l’analyse critique de données scientifiques, la synthèse, la présentation orale, le travail en groupe, l’écriture et la conception de projets ou de travaux de synthèse.

Le semestre 2 est un parcours personnalisé via un large choix de modules optionnels, et d’un stage de recherche de 5 mois à l’étranger (majoritairement en Amérique du Nord). L'UE de tronc commun "Académie Vivante" faisant un lien entre Arts et Sciences s'ajoute aux UE optionnelles.

Année de Master 2

Le semestre 3 du Master est hautement personnalisé. Les étudiants ont 1 UE obligatoire (un travail bibliographique à présenter sous forme d’un cours), 1 module Erasmus à choisir parmi 6 possibilités, et des modules à choix parmi 30 modules proposés par le master (modules MEG), 9 cours présentés par l’Institut Pasteur ou des modules externes au master de génétique. Les modules MEG, faisant intervenir des spécialistes du domaine traité, sont organisés par des chercheurs et enseignants-chercheurs issus d'instituts de recherche internationalement reconnus (Institut Pasteur, IJM, EDC, Cochin, Necker, Curie, IUH, etc.).

Les étudiants ont également la possibilité de suivre une partie du S3 (15 ECTS) dans une université partenaire dans le cadre des doubles diplômes mis en place avec les universités de Milan, Padoue, Trieste et Rome.

Le semestre 4 correspond au stage de recherche de 6 mois dans une des 300 équipes d’accueil validées par l’équipe pédagogique sur la base de leur excellence scientifique, hautes capacités d’encadrement et large répartition dans diverses écoles doctorales. Ce travail de recherche au cours du stage de M2 donne lieu à la rédaction d’un rapport et d’une présentation devant un jury.

Description des UE

UE du semestre 1

UE1 - Génomique Fonctionnelle et Génétique Humaine : aspects  essentiels  de  la  génomique (structure et évolution  des génomes, méthodes d'analyse notamment bioinformatiques). La  variabilité  génétique  humaine  est  particulièrement  mise  en  avant  de  façon  à aborder les notions essentielles de diversité au sein de populations et de causalité vis-à-vis de maladies.

UE2 - Régulation de l’expression génique et épigénétique : les concepts fondamentaux de la régulation de l'expression génique et de fluidité des génomes sont abordés en prenant comme exemple des travaux de recherche actuels

UE3 - Génétique du développement : concepts fondamentaux de  la  biologie  du  développement, avec une approche comparative multi-organismes, permettant d’intégrer, quand cela est possible, une dimension évolutive et écologique.

UE4 - Biologie et pathologies moléculaires et cellulaires : bases moléculaires de processus cellulaires comme le trafic intracellulaire, le métabolisme des lipides, l'apoptose... et leur altération dans certaines pathologies. Les méthodes mises en oeuvre pour étudier ces processus sont discutées

UE5 - L’objectif de cet enseignement est d’intégrer les approches de génétique, génomique et biologie moléculaire, à l'analyse des données biologiques massives (séquençage des génomes, transcriptomes, protéomes,...). Les méthodes et outils d'analyse y sont enseignés. Les étudiants apprennent notamment les langages informatiques Unix et R ainsi que des outils informatiques métiers dédiés à ces analyses. Ces enseignements sont dispensés sous la forme de projets. Cet enseignement a bénéficié d'un financement spécifique de l'EUR GENE et de la Région Ile-de-France qui a permis la mise en place d'un serveur dédié à de telles analyses.

UE6 - Projet de Recherche : Les étudiants apprennent à écrire un projet de recherche pour l'obtention d'un financement pour un projet de deux ans. Les étudiants sont encadrés par un tuteur qui est un directeur de recherche ou un chercheur expérimenté.

UE7 à 10 - Travaux pratiques : les étudiants suivent un TP parmi les 4 possibles : Régulations épigénétiques, Biologie de la Différenciation cellulaire, Biologie Moléculaire Végétale, Génétique du Développement de la Drosophile

UE11 - Communication Scientifique : Ce  module  a  pour  objectif  de  vous  familiariser  avec  plusieurs moyens  de  diffusion  de  l’information  scientifique (l’article scientifique, le résumé et le blog). Les étudiants assisteront notamment à un atelier d’écriture, puis réaliseront un billet de blog ; celle-ci sera faite de manière progressive par des allers/retours entre les étudiants, les enseignants et des blogueurs.

UE du semestre 2

UE12 (obligatoire) - Académie Vivante : une approche innovante de l'enseignement à l'interface des Arts et de la Science, en collaboration avec Bétonsalon, centre d'art et de recherche.

UE13 à 32 optionnelles : les étudiants choisissent 6 options parmi une liste de 20 : Cellules Souche et Thérapie Génique, Diversité et évolution des systèmes génétiques, Du gène à la physiologie, Fluidité génétique, Génétique humaine et pathologies, Génétique humaine méthodologique, Génomique-Bioinformatique, Imagerie Cellulaire, Immunologie : des bases à la physiopathologie, La génétique à l’heure de la génomique, Les ARN non-codants chez les métazoaires et chez les plantes, Mécanismes Epigénétiques: des organismes modèles à l’Homme, Microbiologie, Neurosciences, Oncogénèse, Plasticité et évolution du développement, Recherche et Développement en Entreprise, Mathematical modeling for biologists, Stabilité des génomes et des épigénomes, Virologie

UE33 - Stage : les étudiants effectuent un stage de 5 mois (avril - août) dans un laboratoire de recherche. Ces stages se passent sauf exception à l'étranger, et pour la plupart aux Etats-Unis d'Amérique (New York University, Cold Spring Harbor Laboratory, Albert Einstein College of Medicine, Harvard University, Cornell Medical School, St-Jude Children's Research Hospital-Memphis, Yale University, University of California San Francisco, University of California San Diego,...). Un mémoire est écrit à la fin du stage suivi d'une soutenance.

Année de Master 2

UE du semestre 3

Le S3 (30 ECTS) est hautement modulable

UE obligatoire (5 ECTS) - travail bibliographique à présenter sous forme d’un cours

UE obligatoire (4 ECTS) - module Erasmus d’une semaine à choisir parmi 7 possibilités (Milan, Trieste, Padoue, Barcelone, Athènes, Florence, Rome)

UE à choix (21 ECTS) : un grand choix de modules est ici proposé afin que le parcours soit personnalisable.

-          30 modules sont proposés par le master de génétique dans les domaines de la génétique, génétique évolutive, épigénétique, développement, analyse de données massives, cellules souches, cancérologie, biologie cellulaire, neurologie, microbiologie, création d’entreprise.

Les modules MEG, faisant intervenir des spécialistes du domaine traité, sont organisés par des chercheurs et enseignants-chercheurs issus d'instituts de recherche internationalement reconnus (Institut Pasteur, IJM, EDC, Cochin, Necker, Curie, IUH, etc.).

-          9 cours proposés par l’Institut Pasteur sont accessibles (Mouse Genetics, Advanced Immunology, Molecular Biology of the Cell, Génétique et Epigénétique Moléculaires, Analyse des Génomes, Development and plasticity of the nervous system, Rôles multiples de l’ARN, Human population genomics and genetic epidemiology, Principles and applications of fluorescence microscopy).

-          Modules externes au master de génétique (maximum de 6 ECTS).

Les étudiants ont également la possibilité de suivre une partie du S3 (15 ECTS) dans une université partenaire dans le cadre des doubles diplômes mis en place avec les universités de Milan, Padoue, Trieste et Rome.

UE du semestre 4

Le S4 (30 ECTS) correspond au stage de recherche de 6 mois dans une des 300 équipes d’accueil validées par l’équipe pédagogique sur la base de leur excellence scientifique, hautes capacités d’encadrement et large répartition dans diverses écoles doctorales. Ce travail de recherche au cours du stage de M2 donne lieu à la rédaction d’un rapport et d’une présentation devant un jury.